شنبه یازدهم خرداد ماه ۱۳۹۸ ، تقی رحمانی ، همسر نرگس محمدی از وخامت وضع جسمی همسرش و محرومیت دارویی وی در زندان ، پس از انجام عمل جراحی که در روزهای گذشته انجام شده بود، خبر داد.
نرگس محمدی محبوس در زندان اوین پس از عمل جراحی و بازگردانده شدن به زندان دچار عفونت پس از عمل شده است. این عفونت به دلیل محرومیت از داروهای آنتی بیوتیک بوجود آمده است. وی روز سه شنبه ۲۴ اردیبهشت ماه جهت انجام عمل جراحی هیسترکتومی (خارج کردن رحم)، تحت الحفظ نیروهای امنیتی به بیمارستان منتقل و تحت عمل جراحی قرار گرفته بود، او پس از عمل به زندان برگردانده شد.
انتقال وی به بیمارستان در حالی صورت گرفت، که دادستانی تهران علیرغم پیگیری و درخواست مکرر خانواده و وکیل ایشان با مرخصی استعلاجی درمانی وی مخالفت کرده بود. وی نهایتا در تاریخ ۵ خرداد ۹۸، علیرغم نیاز به مراقبت های پزشکی به زندان بازگردانده شد
وکیل مدافع نرگس محمدی ، محمود بهزادی راد با اعطای مرخصی استعلاجی به وی خبر داد و گفته بود که موضوع برای اتخاذ تصمیم نهایی به دادستان تهران ارجاع شده است. محمود بهزادی راد در اسفندماه ۱۳۹۷، از مخالفت رئیس بهداری زندان اوین با اعزام نرگس محمدی به بیمارستان خارج از زندان خبر داده و اعلام کرده بود که این امر غیرقانونی است زیرا رئیس بهداری زندان در جایگاهی نیست که بتواند بر خلاف دستور دادیار ناظر زندان عمل کند.
نرگس محمدی طی این سال‌ها سه بار تحت عمل جراحی قرار گرفته است.
